Das fachdidaktische Studium zielt als erste Phase der Lehrerbildung darauf, die Studierenden zur von wissenschaftlichen Kriterien geleiteten Planung, Durchführung und Evaluation von Deutschunterricht zu befähigen. Thematisiert werden u.a. die Auswahl von Unterrichtsgegenständen, die Zielorientierung von Deutschunterricht, Steuerungsinstrumente und Diagnosemöglichkeiten im Deutschunterricht. Eine Besonderheit der Jenaer Lehramtsstudiengänge Deutsch ist, dass Fachwissenschaft und Fachdidaktik nicht nur nebeneinander studiert, sondern aufs Engste miteinander verzahnt werden. Zu diesem Zweck werden spezielle Module angeboten, die jeweils von einer/m Lehrenden der Fachwissenschaft und der Fachdidaktik gemeinsam durchgeführt werden („Linguistik und Schule“ sowie „Literaturwissenschaft und Schule“).